Parquemet quiere poner énfasis en este tema a través de Chile Nativo, proyecto que está enfocado en la concientización y educación de sus visitantes sobre la fauna chilena. Consistirá de un área de 2,3 hectáreas, con 16 exhibidores climatizados de estándar internacional, que se suman a las 4,8 hectáreas que conforman actualmente el Zoológico Nacional. Durante el recorrido por Chile Nativo se podrá encontrar alrededor de 60 especies nacionales que en su mayoría están en peligro de extinción y/o rehabilitación en el Centro de Conservación del Zoológico Nacional, algunas de las cuales serán escogidas por un comité biológico compuesto por especialistas e integrantes de diferentes ONGs para su constante estudio, dentro de las cuales destacan las ranas del Loa y de Darwin, entre otras. Al final del trayecto se encontrará el aviario más grande de Chile, con 12.000 m², que representa al altiplano nortino. Este será realizado por el arquitecto Martín Holmes y lo habitarán 50 ejemplares de 12 especies distintas, como: cóndores, flamencos y patos, entre otros.